Berikut adalah daftar jemaah haji Embarkasi Surabaya yang meninggal dunia:
- Istiyono Taslim Atmo Suwito (60), kloter 3 dari Kabupaten Tulungagung. Meninggal dunia di RS Haji pada 4 Mei 2025 karena menderita TB, stroke, dan kencing manis.
- Supatmi Supriadi Hasan (68), kloter 29 dari Kabupaten Bangkalan. Meninggal dunia di RS Haji pada 10 Mei 2025 karena sakit saluran pernapasan.
- Ummu Sopiyah (51), kloter 14 dari Kabupaten Gresik. Meninggal dunia di RS Haji pada 20 Mei 2025.
- Nur Fadilah (45), kloter 20 dari Kabupaten Sidoarjo. Meninggal dunia di pesawat menuju Tanah Suci pada 8 Mei 2025 karena cardiac arrest.
- Inten Retno Wati (56), kloter 5 dari Kabupaten Kediri. Meninggal dunia di Arab Saudi pada 14 Mei 2025 karena Septic Shock dan Multi-organ Failure. Dimakamkan di Syara Makkah.
- Soesanto Soemantri Notodiarjo (73), kloter 16 dari Kota Surabaya. Meninggal dunia di Arab Saudi pada 17 Mei 2025. Dimakamkan di Baqi Madinah.
- Muhadi Madris (74), kloter 9 dari Kabupaten Blitar. Meninggal dunia di Arab Saudi. Dimakamkan di Pemakaman Syaraya Mekkah.
- Naki Muhammad Tang Laddu (74), kloter 74 asal Nusa Tenggara Timur (NTT). Meninggal dunia di RS Haji pada 24 Mei 2025 karena kanker paru-paru.
- Sri Umami Kasih (61), kloter 85 dari Kabupaten Probolinggo. Meninggal dunia di pesawat pada 27 Mei 2025 karena sakit.
- Masiah Joyosijas Sarpan (59), kloter 64 asal Kabupaten Bojonegoro. Meninggal dunia di Arab Saudi pada 21 Mei 2025.
- Gogok Priadi (66), kloter 76 dari Kota Malang. Meninggal dunia di Arab Saudi pada 25 Mei 2025.
- Arsan (92), jemaah dari Kabupaten Malang. Meninggal dunia di Arab Saudi pada 27 Mei 2025.



